2021年6月，PNAS 杂志在线发表了来自德国慕大学等单位合作题为＂A chromosome-level genome of a Kordofan melon illuminates the origin of domesticated watermelons＂的研究论文。该研究改写了驯化西瓜的起源，揭示西瓜祖先最有可能来自非洲东北部的苏丹野生西瓜C. lanatus，而不是之前认为的南非。
　　该研究对数百个人工种植西瓜品种和6种野生西瓜品种进行了全面的基因测序。研究发现相比分析的其他种类，现代种植西瓜的基因组与苏丹野生C. lanatus的关系更密切，因此其是驯化西瓜的近亲，也是一种可能的祖先。C. lanatus是具有不苦的白色果肉，瓜果，主要用作动物饲料。
　　此外，为了深入了解从祖先到驯化西瓜发生的遗传变化，该研究还在染色体水平上组装并注释了科尔多凡甜瓜的基因组。研究表明很有可能是古代农民培育出了这种野生西瓜的非苦味变种，并在种植过程中在许多代的时间里，使其甜度逐渐增加。红色的瓜瓤可能也是人工选择的结果，农民很可能偏爱并有选择地培育红瓤的西瓜。
　　此外，早在3300年前，古代埃及国王图坦卡蒙的墓葬里就放入了西瓜籽，但这还不足以证明那时就有驯化的甜西瓜。而在据信已有4300多年历史的埃及古墓的画中发现了一种类似西瓜的水果。此外，在另一座墓中也有一张图显示，切开的西瓜与葡萄等其他甜味水果一道放在托盘上，这就表明西瓜很可能是那时在埃及或这个古老王国的贸易范围内被驯化种植的。
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