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　　蛋白质二级结构（secondarystructureofprotein）是指多肽主链骨架原子沿一定的轴盘旋或折叠而形成的特定的构象，即肽链主链骨架原子的空间位置排布，不涉及氨基酸残基侧链。蛋白质二级结构的主要形式包括alpha；螺旋、beta；折叠、beta；转角和无规卷曲。
　　alpha；螺旋
　　蛋白质分子中多个肽平面通过氨基酸a碳原子的旋转，使多蛋白质的二级结构肽主链各原子沿中心轴向右盘曲形成稳定的alpha；螺旋（ahelix）构象。
　　alpha；螺旋具有下列特征：
　　（1）多肽链以肽单元为基本单位，以Calpha；为旋转点形成右手螺旋，氨基酸残基的侧链基团伸向螺旋的外侧。
　　（2）每3。6个氨基酸旋转一周，螺距为0。54nm，每个氨基酸残基的高度为0。15nm，肽键平面与中心轴平行。
　　（3）氢键是alpha；螺旋稳定的主要次级键。相邻螺旋之间形成链内氢键，即每个肽单位N上的氢原子与第四个肽单位羰基上的氧原子生成氢键，氢键与中心轴平行。若氢键破坏，alpha；螺旋构象即被破坏。
　　alpha；螺旋的形成和稳定性受肽链中氨基酸残基侧链基团的形状、大小及电荷等影响。如多肽中连续存在酸性或碱性氨基酸，由于带同性电荷而相斥，阻止链内氢键形成趋势而不利于alpha；螺旋的生成。

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